木材防腐治疗有利有弊。如果防腐处理没有做好或者处理不当，或者防腐木材用错了地方，一些传统的防腐药剂和他们的防腐处理的木材都会造成一些轻微的伤害。
木材实力
防腐处理或多或少会影响木材的力学性能，导致木材强度的损失，但影响与一系列因素有关，包括木材龋坏、大小、防腐前的预处理(尤其是木材含水量)、防腐处理过程(压力、温度、时间等。)，后处理和木材二次烘干。通常采用防腐木材作为承重结构材料时，木材的原强度值要调整降低0 ~ 10%。当防腐木材作为非承重结构材料时，防腐处理对木材的强度可以忽略不计。
但如果防腐剂、防腐处理工艺、木材处理得当，防腐处理造成的强度降低是有限的。一些木材防腐先进或发达国家对防腐处理工艺有具体要求，以防止或减少防腐剂(尤其是水性防腐剂)造成的木材强度损失。
如果使用不是防腐的普通木材，在潮湿环境下使用的话，木材因虫蛀造成的强度损失会更大。比如衰变导致木材质量损失5% ~ 10%时，木材强度一般会下降20% ~ 80%。木材衰变的危害在于，初期衰变难以察觉和检测。当观察到衰变时，木材强度的损失往往超过l0%。所以从结构安全的角度来说，用防腐木材比用普通(不是防腐)木材更安全。
油漆、饰面
防腐木材的油漆和涂饰性能与所用木材防腐剂的类型有关。油溶性的Kreisu油或者用防腐油处理过的木材，上漆性差，无法完成。如果需要油漆，用防腐油处理的木材要风化1 ~ 2年后才能涂饰和上漆，一般只能用油溶性半透明的着色剂。另一方面，用防腐油处理过的木材一般只用于铁路枕木、电杆等工业用途，不在人们生活的视线之内，不与人接触。因此，不需要油漆或完成。
对于水性防腐剂处理的木材，只要防腐剂和防腐处理得当，不会影响油漆和涂饰性能。很多情况下，用水性防腐剂处理的木材需要表面包覆。原因如下:第一，木材的水性防腐剂处理多用于民用场合，或应用于人们生活的景观和视野中，表面涂饰可以使木材更加美观；第二，表面整饰可以减少木材的风化，更长久的保持木材的美感。
腐蚀性
木材金属的腐蚀性(连接器、密封外壳等。)与木材含水量、温度、pH值、木材内含物(抽提物)和使用环境(如盐和污染物)有关。木材本身对金属有腐蚀性，但不明显是因为普通(不是防腐)木材多用于室内和干燥环境。与普通木材相比，防腐木材中的化学物质含量增加，特别是防腐木材多用于室外和环境条件恶劣的潮湿场所，因此对金属的腐蚀性增加。
木材对金属腐蚀性的大小。用一般腐蚀率来衡量。防腐木材的腐蚀性常用于比较不同防腐药剂的腐蚀性。但需要注意的是，它比较的是防腐木材和普通木材在金属腐蚀性上的区别，而不是木材防腐药剂本身的腐蚀性。作为一般准则，热浸镀锌或不锈钢产品应用于防腐木材金属连接器和紧固件。